Естественно-научный профиль ориентируется на такие сферы деятельности, как медицина, биотехнологии, сельское хозяйство, нефтегазовое хозяйство и др.
Учебный план естественно-научного профиля обучения содержит 16 учебных предметов и 3 элективных курса: из них изучаются предметы на углубленном уровне:
- Алгебра и начала математического анализа, Геометрия, Вероятность и статистика;
- Химия;
- Биология.